La Commissione Amministrativa era eletta dal Consiglio dei Delegati; la sua durata e il numero dei componenti, che subirono delle modificazioni nel corso degli anni, erano regolati dallo Statuto consorziale.
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Dalla seduta del 22 dicembre 1961 la Commissione Amministrativa assunse la denominazione di Deputazione Amministrativa. Compiti della Commissione amministrativa erano: la convocazione del Consiglio dei Delegati e la proposta dell'ordine del giorno, la gestione del personale, l'assunzione di delibere di spesa riguardo l'erogazione delle somme previste in bilancio, e, in generale, provvedere alla buona amministrazione del Consorzio subordinatamente alle deliberazioni del Consiglio dei Delegati. La Commissione Amministrativa era convocata dal Presidente del consorzio e in caso d'urgenza provvedeva a deliberare in vece del Consiglio dei Delegati, con successiva ratifica nella prima adunanza del Consiglio.